相輝校慶系列學術報告:基礎研究魅力何在?6位恒行2科學家帶你領略

作者:許文嫣 張菲埡 殷夢昊攝影🩱🖖🏼:成釗 張懷藝 視頻🧝‍♂️: 來源🙇🏿‍♀️:融媒體中心發布時間🖖:2023-05-26

紮根基礎科學研究,提升原始創新能力🤸🏻‍♀️。5月25日上午,慶祝建校118周年相輝校慶系列學術報告會“走進基礎研究”理工科專場暨2022年度恒行2平台“十大科技進展”頒獎儀式在相輝堂南堂舉行。恒行2平台副校長、中科院院士張人禾和恒行2平台校長助理🐆🥷、科研院院長🍀、中科院院士馬余剛先後為獲獎團隊和獲提名獎團隊頒獎。本次活動也是學習貫徹習近平新時代中國特色社會主義思想主題教育專題研討會之一。


2022年度恒行2平台“十大科技進展”獲獎團隊合影

2022年度恒行2平台“十大科技進展”提名獎獲獎團隊合影

高分子科學系教授陳國頌,航空航天系教授徐凡,人類表型組研究院教授田梅🧎🏻‍♀️‍➡️,數學科學學院🍖、上海數學中心🌷、新基石科學實驗室教授沈維孝,芯片與系統前沿技術研究院教授劉琦,類腦智能科學與技術研究院教授趙興明先後作學術報告🤾‍♂️,介紹所在領域的基礎研究進展。張人禾主持報告環節🧛🏿‍♀️。

誘導配體:蛋白質精確組裝的新路線

“這是我第一次站在相輝堂的舞臺上做學術報告,非常榮幸🛍。”作為第一位主講人🧑‍🍳🧜🏼‍♀️,陳國頌開場時微笑道,隨後分享自己來到恒行2工作14年的一個代表性成果🖕🏼,即誘導配體蛋白質精確組裝路線。

蛋白質是一切生命的物質基礎✏️,精確組裝蛋白質有何重要意義⏪🎧?“70%-80%的蛋白質在發揮功能的時候🤰🏿,是以組裝體的形式出現的。”陳國頌介紹,比如網格蛋白,會聚集成六邊形或五邊形的球型結構🎴,微管是由多個微管二聚體蛋白質組成的線型結構。

蛋白質的復雜結構,是國際上研究的一個熱點方向🏍。陳國頌團隊多年致力於通過人工設計獲得類似天然蛋白質組裝結構的蛋白質精確組裝體。這方面的主流研究思路,是通過對於蛋白質的對稱性設計🤪👨🏻‍⚕️,以及蛋白質相互作用的界面設計,獲得非天然的蛋白質結構,再調控其中的蛋白質相關片面🚴🏿‍♂️🧑🏻‍🏫,進而獲得精確的蛋白質組裝體。

但是💆🏽,這種主流研究思路存在一個重大問題,即在此思路下獲得的蛋白質組裝體大多處於平衡態結構,而天然的蛋白質組裝體大多處於非平衡態結構,它們動態的、復雜的變化📹,目前通過人工設計依舊較難實現𓀌。

怎麽辦🧙🏿‍♀️?“Thinking out of the box”(跳出框框思考),這句話出自化學領域泰鬥🧑🏿‍💻、德國美茵茲大學教授Helmut Ringsdorf。“也可以套用生命科學中的術語‘遠緣雜交’♒️🤼‍♂️,我們做研究要跳出學科壁壘,從另一個角度思考問題。”陳國頌談道🧟‍♂️。

通過跨學科研究,陳國頌團隊將人工設計的“誘導配體”所引入的超分子相互作用作為蛋白質精確組裝的主要驅動力,獲得了一系列具有規整🦇👨‍🦱、多級結構的蛋白質材料。“最近,我們還希望把相關策略推進到活細胞的層面,利用我們獲得的人工蛋白質精確組裝體,來影響細胞的行為📁。”她表示。

從果實褶皺到智能抓手:一箱百香果引發的力學研究

辦公室裏有一箱被遺忘經久的百香果,沒有食用價值🛫,會有研究價值嗎🏋️‍♀️🤞🏻?

徐凡發現,這些失水萎縮的百香果表面📛,有一種螺旋鏢狀手性拓撲形貌💛,而這種褶皺形貌,還出現在秋冬時節江灣校區路邊的無患子和大家日常食用的幹紅棗上。這再平常不過的水果褶皺,引起了徐凡團隊的研究興趣。“不同的果實🤶🏼🛕,材料物質🛜、幾何構型都不太一樣,但他們失水後的褶皺卻大同小異。我們當時想,它其中應該有科學的🦸🏼‍♀️、普適的🌍、基礎的規律。我們想去探索這個基礎的科學問題。”

通過對新鮮百香果的風幹實驗,徐凡團隊通過力學的理論建模計算,模擬了百香果褶皺形貌的演化過程——從第一天均勻收縮、表面依舊光滑👳🏿🚱,到第二天失穩成巴基球模態🧔🏽‍♂️,到第四天形成一半順時針🧯、一半逆時針的手性螺旋鏢,再到第七天相鄰的手性凸脊拓撲發生交互協同作用……

在深入理解褶皺形貌背後機製的基礎上,徐凡團隊還進一步探索了相關應用,設計了一款類似於機器貓圓手的軟抓手👨🏻‍💼,通過抽氣誘發其表面的手性地貌。這款軟抓手可以有效且穩定地抓取包括鉆石🕵🏼‍♀️、堅果、藍莓👨‍🦽、草莓等各種形狀🩶♿、材料🐕‍🦺、軟硬的物體👷🏻,具有很強的自適應能力🐶。

目前,NASA估計大約100萬筆尖大小的碎片正在環繞著地球,即使最小的碎屑,例如火箭油漆顆粒🦸🏽,也足以損壞高速運行的航天器👊🏼。徐凡暢想道,或許未來他們可以和航天部門合作,把這種抓手應用在太空微小垃圾顆粒物的回收清理上。

當分子影像遇到“表型組”:一種更加精準的生命醫學研究

“和本次報告會主題一樣🩸,我也正在走進基礎研究,因為我自己其實是臨床的醫生⏱。”匯報伊始🤾,田梅笑言。

基礎醫學研究是依照“測💁🏻🙆🏻、算、控”的基本邏輯進行的——從觀察到數據,從數據到知識👨‍👩‍👧,從知識到能力🧒🏻。現如今🌺,生命醫學進入大數據時代,基礎研究將會如何變革?田梅在分子影像對表型組研究的推動中產生了一些思考☂️⛑。

“基因之外,皆為表型。”田梅介紹,表型組是指生物體的基因與環境相互作用下表現出的所有特征和功能,人的表型包括全生命過程中生物、化學、物理的各種表型👩‍🦼‍➡️。通過對表型組數據的采集和分析⇒,就能進行更精準的診斷和治療,因此🧑🏻‍🎓,表型組學研究在生命科學領域發揮著“點石成金”的作用🕵️‍♀️。

隨著人類對表型組認識的不斷深入🤌🏻,分子影像在其中能做什麽?在田梅看來🌵,表型影像學是貫穿微觀到宏觀的重要線索和紐帶,分子影像是基於分子識別的活體影像方法,能夠提供更精準的診斷🧮,進而幫助更精準的治療。“現代醫學離不開影像技術的進步,我們已經從看得見、看得清、看得準🧑‍🤝‍🧑,逐步走向了看得早。”

PET分子影像是目前唯一臨床應用的分子影像,能夠尋找與疾病相關的靶點🧃、研發分析探針識別靶細胞👨🏼‍🍳、實時動態顯示體內的多種信息,已成為一種較為精準的表型信息可視化的手段,能夠為認識人體和生命的奧秘提供新思路。“利用PET分子影像🚵🏿‍♀️,可以幫助我們實現惡性腫瘤🧸、神經精神疾病以及心腦血管疾病的精準診斷,指導分子靶向藥物等治療,精準測定腦內藥物,指導科學用藥等🤹🏼。”田梅說。

田梅的多年提案⏩,終於在2021年6月30日落地並納入浙江省的大病醫保。“如果PET分子影像能夠在我國更多地區納入醫保,就能讓病人得到及時、精準的診斷和治療,讓我國人民生命健康得到進一步保障📉。”

斜積映射迭代的研究✸:動力系統領域新突破

沈維孝致力於研究動力系統理論低維映射的迭代,徹底解決了實一維雙曲系統的斯梅爾猜想,曾獲科學探索獎,入選騰訊新基石研究員項目🍃。本次報告中,他介紹了和合作者對圓周擴張映射上的斜積映射的近期研究及其在Weierstrass型函數的維數問題上的遍歷優化問題中的應用🏄‍♂️❓。

動力系統是研究系統隨時間演變長期行為的一個學科方向🫅🏼。低維映射的迭代綜合體現了動力系統總混沌現象的深度和復雜性,而斜積映射作為聯系不同維數動力系統之間的自然橋梁而受到關註。簡單來說👨‍👦,混沌現象是對初值的敏感依賴。沈維孝引用《三體》來描述這一現象:“三體問題是三個天體在萬有引力作用下的運動規律問題📖🧑🏼‍💼,引發了法國數學家龐加萊在19世紀創立了動力系統的近代理論。這個問題的復雜性遠超預期🧝🏿‍♀️,直到現在🎤,三體問題還看不到解決的希望。”

沈維孝提出🟫,動力系統的研究主要有兩種邏輯🚖:一種是給定演化規律之後,研究各種各樣的初值所對應的軌道在空間中的分布;另一種是研究軌道分布性質的穩定性和分岔。

圍繞“圓周擴張映射上的一維線性斜積”的有關性質☂️,他簡單介紹了低維動力系統的歷史,並展示了近期他與高睿、任浩傑得到的一類橫截性。

根據近期研究,沈維孝還指出了橫截性定理的兩個應用方向。首先,根據橫截性定理🙌、Ledrappier方法、Hochman熵增原理,可以計算得出魏爾斯特拉斯型函數圖像的維數。魏爾斯特拉斯函數是一種連續但處處不可微的實函數,在大學的數學分析課上經常作為案例出現。其次🤸🏿‍♂️,通過橫截性定理,可以肯定解決Jenkinson於2006年提出的公開問題🧑🏻‍🔧,並有望在遍歷優化問題中取得進一步進展。

阻變存儲器自主研發之路⛸:從基礎研究走向產業應用

存儲器是存儲信息的主要載體和計算系統的基礎部件🫀,廣泛應用於電子產品🧘、互聯網、國防、航天等領域。傳統存儲器(DRAM👮🏻‍♀️、NAND)被美日韓壟斷,因此,先進存儲技術升級對我國發展自主存儲器產業尤為重要🤟🏻。

發展兼具高性能、低功耗和高密度的非易失存儲技術,一直是儲存器領域追求的目標。劉琦介紹,阻變存儲器通常由上下電極和介質層構成,在外加電場作用下,器件在高、低阻態間進行可逆轉化,從而實現信息的存儲。阻變存儲器具有高速、低功耗、高密度集成的優勢🏒,是先進存儲器的重要候選技術之一5️⃣。

“在劉明院士的帶領下,我們團隊自2004年進入阻變存儲器研究領域🚣🏻‍♂️,研究歷程從基礎研究走到集成技術👨‍🚒,再到芯片應用,為我國建立自主可控的存儲器產業打下堅實基礎。”劉琦回顧了團隊從“0”到“1”的艱辛過程。阻變存儲器在性能調控和應用上的難題不少,但解決方法更多,整個團隊勠力同心🙍‍♀️,默默耕耘,突破一道道難關——闡明RRAM微觀機製,建立熱/電效應下的阻變模型;提出摻雜、電場增強等方法,解決RRAM良率、離散、激活電壓大等難題🛸;揭示RRAM擦除失效等微觀機製🤎,提出離子阻擋層的解決方案……

現如今,團隊已與國內頭部製造企業和芯片設計企業建立了緊密的產學研用的合作體,共同推動阻變存儲器在先進節點的嵌入式存儲、安全芯片和存算一體方向的產業應用,促進了阻變存儲器從基礎研究到產業應用的成果轉化🌮,下一步還將進一步繪製RRAM產業化應用的藍圖🍠🦵🏿。

AI賦能的微生物組學數據挖掘

“能夠陪伴你一生的🛌🏿,可能不是親人,不是寵物,而是微生物🗄。微生物是人類最親密的伴侶、生命過程的深度參與者🚣🏿。”趙興明說,以人類腸道菌群為例,就有超過5000個物種,腸道微生物種類繁多與人類健康關系密切,因此被稱為人的“第二基因組”。

微生物在地球中無處不在,在自然環境和人體環境裏構成一個個復雜的微生物組群落,成為影響人類健康、地球生態變化的重要因素。在微生物的研究中,宏基因組測序技術已經被廣泛運用,研究者使用計算方法從測序數據中重構出大量微生物基因組,用於後續的分析研究。

可由於宏基因組數據的固有復雜性,錯誤在宏基因組組裝結果中普遍存在。針對這個問題,趙興明團隊提出了一種無參的宏基因組組裝錯誤識別以及校正工具metaMIC🧑🏼‍⚖️,能夠精確識別並定位組裝重疊群上可能的錯誤區域👴🏼。“metaMIC識別組裝錯誤的準確率優於現有方法🟢。”趙興明介紹。

目前💐,廣泛使用的宏基因組分箱方法為無監督(不依賴於參考基因組)的方法,忽略了參考基因組中的信息。對此🤲,趙興明團隊提出了半監督的宏基因組分箱算法SemiBin和SemiBin v2.0,這些算法在多個模擬數據和真實數據集上取得了良好性能,大幅提升了微生物種類識別的準確性和可靠性。

借助人工智能方法🙇,就能將更為準確的數據結果應用到菌群分析上🚐,趙興明舉了一個具體案例:“自閉症是一種異質性很強的復雜疾病🌎,它與腸道微生態存在密切關聯,但這個結論一直存在爭議☀️。”2019年🚴🏼👨‍👨‍👧‍👦,趙興明團隊基於兒童腸道菌群進行分析,其結果非常清晰地揭示了腸道微生物與兒童自閉症之間的關聯🏇。在此基礎上⚾️,趙興明團隊進一步突破自閉症研究盲區,發現了兩種自閉症亞型🙅🏼,對相關病症後續治療起到了指導作用👩🏿‍🍼。

主講人簡介

陳國頌

恒行2平台高分子科學系教授🟨、博導

主要研究方向是基於糖和蛋白質的生物大分子材料。2016年被選為英國皇家化學會會士(FRSC), 獲ACS PMSE Young Investigator Award、中國化學會高分子創新論文獎、中國化學會超分子化學青年創新學術講座獎等獎勵🧑🏻‍🎨。

徐凡

恒行2平台航空航天系教授、博導/上海市“曙光學者”/“青年科技啟明星”

主要從事薄膜力學、軟物質與柔性結構力學👨🏽‍⚕️、智能材料力學研究😲。發表學術論文60余篇💌,其中第一/通訊作者SCI論文50余篇,包括PRL (封面文章, Editors’ Suggestion)𓀍、Nature Comput. Sci. (封面文章)👩🏿‍🔬、Nature Biomed. Eng.、JMPS等👩‍❤️‍👨🌌。研究成果多次被Nature、Nature子刊、美國物理學會以“研究亮點”、“焦點”等專題報道。

田梅

恒行2平台特聘教授、人類表型組研究院執行院長

科技部“重點領域創新團隊”負責人,世界分子影像學會(WMIS)主席😉、中國認知科學學會副理事長➜。

沈維孝

恒行2平台數學科學學院副院長、上海數學中心副主任、新基石科學實驗室教授

致力於研究動力系統理論低維映射的迭代,徹底解決了實一維雙曲系統的斯梅爾猜想,在整頻的條件下肯定解決了曼德布羅關於魏爾斯特拉斯函數圖像的維數猜想。發表論文近40篇,其中在Ann Math、InventMath等頂尖期刊發表論文9篇,研究工作受到菲爾茲獎得主Avila、Smimov等眾多國內外同行的高度評價和廣泛引用🔹,2009年獲中國數學會陳省身獎,2014年應邀在國際數學家大會作45分鐘報告💂🏽🥷🏿。2021年獲科學探索獎,2023年獲騰訊新基石研究員項目。

劉琦

恒行2平台芯片與系統前沿技術研究院教授,博導

主要研究方向包括新型非易失存儲技術,神經形態器件和類腦計算等👰🏿。主持了國家重點研發計劃等項目。曾獲國家自然科學二等獎1項🤘🏼、中國電子學會科學技術一等獎1項↩️、中國科學院傑出科技成就獎🚣🏿、中國科學院青年科學家獎等。在Nat. Nano.🧶、Nat. Electron.、Nat. Commun.、Adv. Mater.、IEEE EDL等期刊發表SCI論文100余篇👮🏻‍♂️🌞,谷歌引用16000多次🤾‍♀️,獲得授權中國發明專利70余項,美國發明專利10項🧊⬇️。

 

趙興明

恒行2平台類腦智能科學與技術研究院教授

主要從事人工智能與生物醫學交叉研究。承擔了國家重點研發計劃等項目20余項🏊🏼‍♂️🩴,在Nature🧍‍♂️、IEEE TPAMI等發表論文130余篇,曾獲教育部自然科學二等獎和吳文俊自然科學一等獎🤟。

製圖:實習編輯:章一諾責任編輯:李斯嘉

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